长春中医药大学党委学生工作部、研究生工作部、武装部、学生工作处在学校党委全面领导下，坚持落实立德树人根本任务，以“厚德精术 铸魂树人”为工作理念，立足中医药办学特色，统筹全校本专科生、研究生党建和思想政治教育、事务管理、发展服务、国防教育与安全稳定、“一站式”学生社区建设、队伍建设等核心工作，是学校落实“三全育人”教育理念，培育中医药时代新人的职能机构。

部门下设5个科室，即学生教育科、军事教育科，学生管理科，学生资助与贷款科，大学生心理健康教育咨询中心，研究生管理科。